More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5136 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  41.6 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  41.6 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  36.22 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  36.22 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  37.88 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  37.8 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  47.19 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  39.47 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  40.16 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  36.67 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  38.02 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  37.25 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  34.58 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.64 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  34.65 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  32.94 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  35.85 
 
 		 768 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  28.57 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  30.37 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.29 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30.69 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  30.23 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  29.29 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.18 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  31.18 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  33.68 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  25.26 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.41 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  28.87 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  27.34 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.3 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.9 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  27.72 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  28 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.69 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.04 
 
 		 286 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  30.39 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  29.17 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  31 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.28 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  28.12 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  29.59 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  30.85 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.56 
 
 		 289 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  27.45 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  27.68 
 
 		 238 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  29.7 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  30.95 
 
 		 338 aa  50.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  31 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  31 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  25 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  29.55 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.59 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  30.59 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  28.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  25.53 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  26.51 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0238  thioredoxin, selenocysteine-containing  30.53 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.88 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  29.41 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.29 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  32.88 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  35.14 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  29.81 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  31 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  26.14 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  30.61 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  24.44 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.57 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  29.69 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>