More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2277 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
149 aa  304  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  46.88 
 
 
108 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  41.28 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  40 
 
 
223 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  41.67 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  40.78 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  31.33 
 
 
259 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  36.52 
 
 
259 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.54 
 
 
109 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.27 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  38.54 
 
 
109 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  43.75 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  33.98 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  39.39 
 
 
257 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.01 
 
 
108 aa  92  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.29 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  37.37 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38 
 
 
148 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  36.46 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  38.54 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  37 
 
 
109 aa  91.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  40.62 
 
 
109 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  41.57 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  32.71 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  37.14 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  37.14 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  37.14 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  37.96 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  37.96 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  34.65 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  40.62 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  42.11 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  39.58 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  34.58 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  34.58 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  37.96 
 
 
109 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.19 
 
 
115 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  33 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  35.65 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  38.78 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  39.13 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  38.3 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  35.71 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.71 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  38.04 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  36.54 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  38.78 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  37 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  38 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  41.3 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  36 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  38 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  37 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  37.5 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 
286 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  38.61 
 
 
106 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  36 
 
 
112 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  41.3 
 
 
108 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  40.22 
 
 
108 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  36.21 
 
 
120 aa  87  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  38.54 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  38.54 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  40.62 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  39 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  35.87 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  33.94 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  36.73 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  38 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  37.11 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  42.71 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  38.54 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  38.54 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36.72 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  35 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  38.54 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.64 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  37.21 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  37 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  37 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  39.58 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  37 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  37 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  38 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>