More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1247 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  100 
 
 
113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  50.48 
 
 
106 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  51 
 
 
259 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.69 
 
 
107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  47 
 
 
108 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  45.54 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  44.12 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  51.52 
 
 
259 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  48.6 
 
 
110 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  45.45 
 
 
107 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  42.86 
 
 
110 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.63 
 
 
107 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  47.12 
 
 
116 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  56.32 
 
 
141 aa  104  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  103  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  51.55 
 
 
110 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  42.16 
 
 
106 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  49.47 
 
 
111 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  43 
 
 
107 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  43.3 
 
 
106 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  45.54 
 
 
108 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  45.1 
 
 
115 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  45.1 
 
 
107 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  45.1 
 
 
107 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  39.6 
 
 
105 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.92 
 
 
125 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  44.23 
 
 
107 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48.89 
 
 
124 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  48.89 
 
 
107 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  49.49 
 
 
109 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  44.9 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  46.39 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  46.39 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  44.66 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  43.69 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  46.39 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  45.92 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  40.2 
 
 
105 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  43.27 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  45.63 
 
 
107 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  41.35 
 
 
106 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47.78 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  46 
 
 
106 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48.48 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  45.54 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  47 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  43.27 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  42.31 
 
 
106 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.94 
 
 
107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  45.54 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  45.54 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.61 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47.78 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  42.72 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  47.47 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  45.54 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  41.84 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  45.45 
 
 
257 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  40.59 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  37.62 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.67 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  38.61 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.01 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  42.16 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  43.56 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  44.23 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  42.31 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.32 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.23 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  44.21 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  44.55 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.67 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  44.21 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  39.05 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  49.47 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  39.42 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  44.44 
 
 
238 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  41.9 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  41.35 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  37.62 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  40.38 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  42.31 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  41 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  40.2 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  41.9 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  45.19 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>