More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1333 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  62.26 
 
 		 112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  56.12 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  58.95 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  55.32 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  55.21 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  55.21 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  55.67 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  49.57 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  55.43 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  59.52 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  57.3 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  57.3 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  57.3 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  50.94 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  57.3 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  54.64 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  50 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  53.68 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  55.79 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  46.09 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  50.54 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  51.06 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  52.33 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  51.28 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  43.04 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  30.59 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.97 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.93 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.76 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  38.57 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  27.06 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  39.53 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  33.72 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.19 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  24.39 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  39.53 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  31.76 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  28.17 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.07 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.13 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.95 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  34.26 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  27.91 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  28.16 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  31.52 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  31.52 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  30.95 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  32.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  33.82 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.48 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  34.62 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.75 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  30.86 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.91 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  42.25 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  29.13 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  28.89 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.63 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  32.58 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  30.68 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  32.97 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  25 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  35.96 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  27.06 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  35.96 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  33.85 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  36.23 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  39.73 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  32.69 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  35.14 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.7 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  34.67 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  31.87 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.74 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>