More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1907 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  226  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  63.3 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  62.96 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  51.55 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  51.49 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  47.12 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  56.67 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  52.69 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  53.76 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  54.84 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  53.19 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  54.84 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  54.84 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  54.26 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  47.42 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  52.69 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  52.69 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  46.08 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  47.47 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  49.48 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  48.98 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  56.52 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  51.11 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  51.06 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  45.36 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  44.23 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  47.19 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.67 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  33.75 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  32.97 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  30.09 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  33.72 
 
 		 109 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  31.46 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  31.71 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  31.46 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  33.75 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  31.33 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  32.89 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  32.91 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  33.72 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  38.46 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  33.33 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.53 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  30.39 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  31.65 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.06 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  33.77 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  34.57 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.47 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  27.36 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  35.9 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  33.77 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  29.76 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  32.1 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  32.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  32.1 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  30.1 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  32.1 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  29.13 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.34 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  34.21 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  34.21 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38.67 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.78 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  29.87 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  34.15 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  29.7 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  33.75 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  28.83 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  28.26 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.11 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  34.09 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  32.88 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  32.1 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.05 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.65 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  30.39 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  29.7 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  28.26 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  32.05 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  30.95 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  37.68 
 
 		 406 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  34.57 
 
 		 259 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  25.84 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  36.25 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>