274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0132 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  99.07 
 
 
108 aa  220  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  82.24 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  82.24 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  82.24 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  82.24 
 
 
161 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  80.37 
 
 
135 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  77.57 
 
 
108 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  76.64 
 
 
108 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  64.49 
 
 
106 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  59.8 
 
 
106 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  60.61 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  58.59 
 
 
107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  58.06 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  64.44 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  59.8 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  59.8 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  60.42 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  56.86 
 
 
109 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  56.57 
 
 
110 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  59.6 
 
 
111 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  57.58 
 
 
111 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  57.58 
 
 
111 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  51.52 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  57.3 
 
 
131 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  56.52 
 
 
112 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  56.04 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  45.83 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  51.65 
 
 
112 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  43.93 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  47.19 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28.09 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  34.48 
 
 
102 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  30.95 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.86 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  28.74 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  36.36 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  32.14 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.72 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  28.74 
 
 
768 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  26.92 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  34.92 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  23 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.56 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  34.43 
 
 
123 aa  47.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  33.85 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  28.83 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  30.23 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.89 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.77 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  26.21 
 
 
108 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  30.77 
 
 
125 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  34.72 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.68 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  33.33 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  33.85 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.49 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  33.85 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  29.49 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  34.85 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  26.47 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  36.05 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  36.07 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.71 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  28.89 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  36.05 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.46 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  26.44 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  30.86 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  28.05 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  25.23 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  31.94 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.63 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  31.67 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  31.03 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  29.55 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  36.9 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  34.88 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  33.33 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.63 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  31.52 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  33.33 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  38.57 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  29.07 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  31.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  30.38 
 
 
106 aa  43.9  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  30.43 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  28.42 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  30.99 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  28.89 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32.31 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  30.77 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>