More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1972 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  70 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  67.29 
 
 		 117 aa  157  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  64.81 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  59.81 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  61.54 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  56.86 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  55.21 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  52.78 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  50.94 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  56.84 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  58.51 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  54.08 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  58.51 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  58.51 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  59.14 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  57.45 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  54.17 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  56.38 
 
 		 108 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  46.53 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  56.38 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  49.49 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  47.96 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  49.44 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  33.72 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  32.18 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  27.78 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  31.4 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  28.41 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  36.14 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  36.23 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.68 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  30.68 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  31.4 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  31.4 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  31.4 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  32.91 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.33 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  37.31 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  27.91 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  31.73 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  39.68 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  29.69 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  38.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.33 
 
 		 406 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.11 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  34.12 
 
 		 768 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.17 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  35.23 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  31.65 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  36 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  36 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  34.12 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.62 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  34.12 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  37.18 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  36 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  36 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  36 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  37.18 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  41.43 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  39.71 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  24.42 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  38.24 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.21 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  29.27 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32.93 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  34.52 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  28.42 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  30.59 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  31.4 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  31.4 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  38.1 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.56 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>