130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5143 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  90.74 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  87.04 
 
 		 135 aa  196  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  192  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  76.64 
 
 		 108 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  76.64 
 
 		 108 aa  170  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  76.64 
 
 		 108 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  76.64 
 
 		 108 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  66.98 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  64.49 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  63.64 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  57.41 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  60 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  65.22 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  58.1 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  56.86 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  57.58 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  59.14 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  52.53 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  55.43 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  53.76 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  56.38 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  54.55 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  54.46 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  46.46 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  49.49 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  51.69 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  45.74 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 768 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  36.11 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  36.92 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  35.38 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  37.5 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  34.72 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  34.72 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28.05 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  34.72 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  34.72 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  32.18 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  24.14 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  28.95 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  32.81 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  32.88 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  32.1 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  36.36 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.01 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  32.2 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  29.76 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.76 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.95 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  31.15 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  33.75 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.82 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.18 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  30.56 
 
 		 120 aa  43.9  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.91 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  35.44 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  35.44 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30.3 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  30 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  34.12 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  27.85 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  30.3 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  28.57 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  36.36 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.63 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  31.82 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.94 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  31.25 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  31.65 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  34.18 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.4 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  31.25 
 
 		 132 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  28.79 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.29 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  32.56 
 
 		 107 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 131 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.21 
 
 		 406 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  27.27 
 
 		 88 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  31.25 
 
 		 132 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.25 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  30.68 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  34.52 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.38 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.91 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  26.47 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  32.91 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>