177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0943 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  100 
 
 		 112 aa  229  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  62.26 
 
 		 131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  58.49 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  54.37 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  55.77 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  55.77 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  57.58 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  60.87 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  56.57 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  56.57 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  56.57 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  56.57 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  52.53 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  54.08 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  54.08 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  48.11 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  53.54 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  52.53 
 
 		 135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  53.54 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  54.17 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  48.48 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  51.04 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  42.16 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  49.4 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  35.37 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  31.94 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  24.69 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  28.05 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  22.11 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28.05 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  33.33 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  27.06 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  26.37 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  25.26 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  29.49 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  35.29 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  24.39 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  25 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.76 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  27.85 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  30.67 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  25.88 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  30.85 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  30.95 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  27.03 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  24.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  30.95 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.33 
 
 		 406 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  30.95 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  28.24 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.75 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  35.71 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  24.14 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  22.99 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  26.03 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  32.05 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  35.29 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  23.53 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  27.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  27.08 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  22.11 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  27.96 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  26.44 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  24.42 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  31.03 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  25.58 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  20 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  25 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  25 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  33.77 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  30.49 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  29.79 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  23.08 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  24.42 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  28.75 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  32.14 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  24.42 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  26.13 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>