More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1697 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  237  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  37.3 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  31.33 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  34.83 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.4 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.78 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.62 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  32.43 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  29.55 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  33.78 
 
 		 280 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.78 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  32.43 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  35.63 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  29.07 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  35.14 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  35.71 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.99 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  33.78 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  33.33 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  28.4 
 
 		 768 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.67 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.95 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  32.58 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  38.16 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  34.62 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  31.82 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.73 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  27.38 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.43 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  31.11 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  32.39 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  32.29 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  28.57 
 
 		 259 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  26.97 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  30 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  26.97 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  35.21 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0238  thioredoxin, selenocysteine-containing  36.49 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  34.25 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  29.07 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  31.46 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  28.41 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  32.14 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  35.14 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  28.75 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  35.62 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  26.97 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  32.05 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  27.38 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  35.62 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  28.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  28.57 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  34.67 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  32.43 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  31.33 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  28.21 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  28.21 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.06 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.06 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  31.33 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.99 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  26.8 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  29.49 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  33.78 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  38.57 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.27 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  29.73 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  29.49 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  32.43 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.78 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  35.96 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.78 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.05 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  37.04 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  26.92 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  28.38 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  30.26 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  32.86 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  27.59 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  30.77 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>