More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3319 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  62.96 
 
 		 109 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  60.55 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  47.96 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  46.53 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  46.53 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  53.19 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  45.83 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  45.83 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  45.83 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  45.83 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  48.48 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  50.54 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  44.44 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  46.81 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  46.81 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  50.54 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  45.74 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  45.71 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  47.83 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  42.16 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  43.82 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  34.57 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  33.73 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  41.43 
 
 		 406 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  28.41 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  35.37 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  30.85 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  30.88 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  33.7 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  29.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  35.21 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  29.89 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  32.97 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  28.92 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30.49 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  34.65 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  34.65 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  28.74 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  30.1 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  28.18 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.48 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  34.48 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  28.18 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  34.15 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  29.89 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  30.28 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  30.56 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  31.03 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  28.26 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  28.72 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  30.68 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  30.86 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  39.71 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.95 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29.55 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  31.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  29.17 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  31.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  31.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  27.91 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  28.38 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  22.99 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  31.34 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  31.4 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  36.11 
 
 		 411 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  31.75 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  34.44 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  31.34 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30.85 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.95 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.11 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  30.95 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  32.93 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  27.38 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  24.47 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  28.77 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.08 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  34.62 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>