More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4067 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  220  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  60 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  64.49 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  64.15 
 
 		 108 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  64.15 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  56.6 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  63.11 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  57.41 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  59.26 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  58.33 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  58.33 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  58.33 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  58.33 
 
 		 161 aa  136  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  60.38 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  63.81 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  58.33 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  59.81 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  59.81 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  56.86 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  56.07 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  52.69 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  54.08 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  50.49 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  57.83 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  48.48 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  54.22 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  24.71 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  30.86 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  36.49 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  36.14 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  37.35 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  27.96 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  34.52 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.94 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  38.1 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  30.86 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  35.11 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  28.72 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  28.72 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  28.72 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  32 
 
 		 768 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  27.91 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  35.11 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  31.43 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  32.86 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  30.59 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  38.55 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  28.17 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.34 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  34.94 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  43.94 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  28.24 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14096  predicted protein  39.06 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  35.44 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  26 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  23.94 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  29.21 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.29 
 
 		 406 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.03 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  31.88 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  30.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  29.41 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  28.09 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  29.41 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  28.85 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  28.24 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  30 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  27.06 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  28.05 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  26 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  28.05 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  27.63 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.92 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  31.88 
 
 		 105 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  31.76 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.38 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  28.09 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32.31 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  24.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  26.44 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>