98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03441 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  55.06 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  53.93 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  50.56 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  56.63 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  57.83 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  53.93 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  54.22 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  51.69 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  49.44 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  50.56 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  48.81 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  47.19 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  50.56 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  48.31 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  48.31 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  47.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  47.19 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  47.19 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  48.24 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  49.44 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  49.44 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  51.28 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  43.82 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  49.37 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  49.4 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  48.31 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  34.43 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  31.11 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32.39 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  31.82 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  36.49 
 
 		 768 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  29.87 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  25.64 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  26.98 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  25.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  21.05 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  26.39 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  26.03 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  21.13 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  26.03 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  31.51 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  25.71 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  26.76 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  32.88 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  26.87 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  30.16 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  26.15 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  23.94 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  28.4 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  29.67 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  25 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04700  thiol-disulfide exchange intermediate, putative  39.29 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  25.76 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  24.24 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  36.36 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  29.69 
 
 		 110 aa  42  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  28.99 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  29.31 
 
 		 117 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  25.76 
 
 		 130 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  28.81 
 
 		 123 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  20.9 
 
 		 135 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  27.69 
 
 		 108 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  28.77 
 
 		 110 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  22.54 
 
 		 129 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  29.03 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  21.31 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  29.23 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.25 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  28.57 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  20.55 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  23.81 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  26.14 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  25.76 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  20.29 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  27.54 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  27.27 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  29.69 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  28.57 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  26.76 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  28.79 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  28.79 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  28.79 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  26.92 
 
 		 105 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  21.21 
 
 		 138 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  22.22 
 
 		 103 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>