More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4888 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  64.15 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  64.81 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  64.81 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  58.33 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  60.38 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  66.67 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  65.26 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  58.18 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  58.72 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  53.77 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  57.55 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  57.58 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  56.07 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  56.07 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  56.07 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  57.14 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  60.64 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  53.4 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  59.57 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  58.95 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  53.54 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  51.04 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  49.52 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  49.48 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  47.27 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  53.93 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  35.24 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.5 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  26.44 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  33.03 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  27.45 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  36.99 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.07 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 768 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  34.12 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  31.68 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  31.68 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  34.12 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  25.81 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  34.83 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.11 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  21.84 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  32.11 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  31.58 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  32.11 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.11 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.48 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  32.29 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.58 
 
 		 406 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  36.23 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  29.79 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  28.57 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32.14 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28.72 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  27.72 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  27.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.12 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30.3 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  28.57 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.14 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.14 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.14 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  28.57 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  28.57 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  30.23 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  25.68 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  24.47 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  27.71 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  29.21 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  30.59 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  32.56 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  32.95 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.82 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.18 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>