89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2110 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  100 
 
 		 152 aa  287  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  45.76 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  45.79 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  46.96 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  46.03 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  46.99 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  36.96 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  49.48 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  43.75 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  41.67 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  39.25 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  34.83 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  37.61 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  38.1 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  38.1 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  38.1 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  44.74 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  48.24 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.09 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  29.41 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  33.78 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  36.11 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  28.75 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  30.19 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  29.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  32.05 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  28.77 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  34.62 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  27.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.86 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  34.67 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.15 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  27.47 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  31.65 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  31.11 
 
 		 768 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.63 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  27.47 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.87 
 
 		 109 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32218  predicted protein  35.05 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357833  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  28.26 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  33.72 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.4 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  26.74 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  35.21 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  30.49 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  30.59 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  29.55 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  33.8 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  27.47 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  36.99 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  34.88 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  31.76 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  30.69 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  32.81 
 
 		 104 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  38.03 
 
 		 145 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.8 
 
 		 108 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  28.75 
 
 		 104 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  31.76 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  36.07 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.4 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.49 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  32.39 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  31.76 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  36.99 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.14 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  28.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  31.25 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  36.62 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  25.84 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.29 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  30.26 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  29.07 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.24 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  31.08 
 
 		 107 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  30.12 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  32 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  28.95 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  30 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  32.56 
 
 		 126 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 128 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  30.11 
 
 		 106 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>