62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1559 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  100 
 
 
130 aa  239  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  55.91 
 
 
170 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  46.83 
 
 
175 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  60.67 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  60 
 
 
146 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  59.55 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  50.48 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  60 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  50 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  52.22 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  45.36 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  48.24 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  43.02 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  35.42 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  46.25 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.33 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  43.24 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  33.7 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  27.84 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  29.49 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  28.09 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  26.47 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  34.29 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  33.33 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  26.04 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  29.61 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  26.19 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  39.66 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  26.47 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.07 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  36.36 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  34.09 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.81 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  31.34 
 
 
112 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  32.94 
 
 
106 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.48 
 
 
189 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  35.9 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  25.81 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  26.81 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  31.71 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  29.79 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  21.33 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  19.51 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  26.45 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2837  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  33.77 
 
 
206 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  22.92 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  35.82 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  32 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0664  redoxin domain-containing protein  38.03 
 
 
238 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  35.53 
 
 
108 aa  40  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.22 
 
 
286 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2644  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  38.46 
 
 
206 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>