99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0156 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  99.19 
 
 
123 aa  247  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  93.5 
 
 
123 aa  235  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  82.93 
 
 
126 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  82.93 
 
 
126 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  82.79 
 
 
126 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  80.49 
 
 
126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  80.49 
 
 
126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  80.49 
 
 
126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  80.33 
 
 
126 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  77.31 
 
 
125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  77.31 
 
 
125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  75.63 
 
 
125 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  57.85 
 
 
126 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  55.37 
 
 
126 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  57.26 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  59.38 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  54.74 
 
 
129 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  54.55 
 
 
127 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 
133 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  51.92 
 
 
126 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  44.55 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  44.55 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  51.69 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  47.73 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  45.36 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  48.89 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  52.44 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  49.38 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  30.85 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  27.16 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  26.05 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  34.29 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  26.05 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  37.04 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  26.67 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  31.25 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  26.09 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  30.38 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  25.29 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  39.06 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  31.25 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  29.09 
 
 
123 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  29.11 
 
 
132 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  28.89 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  28.75 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  29.11 
 
 
132 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28.75 
 
 
125 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.1 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32.1 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.1 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  27.27 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  28.77 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  22.5 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  30 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  31.82 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.52 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  29.35 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  27.27 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  30.67 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  37.33 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  27.94 
 
 
123 aa  43.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  24.44 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.43 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.62 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  31.34 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  28.57 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  29.81 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  21.25 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  28.12 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  29.33 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  35.94 
 
 
176 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  28.4 
 
 
104 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  28.81 
 
 
120 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  32.2 
 
 
129 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  25.32 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.61 
 
 
133 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  27.4 
 
 
102 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  30.56 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  23.53 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  21.74 
 
 
123 aa  40.8  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  37.93 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  21.21 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  29.41 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  26.87 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  31.58 
 
 
299 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  25 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  27.87 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  27.27 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  29.41 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0582  thioredoxin-related  31.82 
 
 
109 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.95 
 
 
140 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>