104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3067 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  96.83 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  96.83 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  96.83 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  95.24 
 
 		 126 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  93.65 
 
 		 126 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  83.74 
 
 		 123 aa  219  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  83.74 
 
 		 123 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  82.93 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  80.65 
 
 		 125 aa  206  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  79.51 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  78.69 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  54.47 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  56.1 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  55.56 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  58.76 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  56.25 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  57.95 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  49.45 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  45.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  50.96 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  45.54 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  50.56 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  50.56 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  54.22 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  51.65 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  51.81 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  45.16 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  30.14 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  30.56 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  30 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  25 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  31.25 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  27.27 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  28.12 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  22.69 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  23.53 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  30.14 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  25.56 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  25.76 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  26.56 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  26.56 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  25.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  25.51 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  30.26 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  27.42 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  31.43 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  31.82 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.43 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  34 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  33.33 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  34.38 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  26.15 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  24.24 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  34 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  29.58 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.17 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  30.88 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  24.24 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  25.42 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  31.31 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  22.73 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  31.51 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  25.24 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  31.51 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  31.51 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  32.43 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  29.17 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  27.27 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  30.14 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  27.87 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  26.67 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  25.44 
 
 		 143 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  27.4 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  23 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  24.39 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  24.36 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  27.5 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  31.71 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  26.39 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  31.71 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  31.71 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  29.13 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  29.41 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  28.57 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  28.12 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  36.92 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  24.32 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>