48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3411 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  70.54 
 
 		 129 aa  201  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  58.76 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  58.76 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  62.5 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  50.39 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  58.76 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  58.76 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  60.42 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  60.22 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  58.76 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  57.73 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  58.33 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  57.45 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  51.82 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  55.45 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  54.22 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  48.42 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  51.22 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  44.09 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  41.86 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  44.68 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  39.78 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  46.07 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  30 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  31.65 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  30 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  35.29 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  29.41 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  35.14 
 
 		 105 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  30 
 
 		 137 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  34 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  29.41 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  29.41 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  28.16 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  27.4 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>