More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1672 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  64.71 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  60.47 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  56.25 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  60.71 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  57.95 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  57.95 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  51.16 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  57.14 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  53.28 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  58.33 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  54.12 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  53.26 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  55.95 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  52.27 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  53.41 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  51.58 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  48.39 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  47.92 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  52.75 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  48.42 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  51.49 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  47.56 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  40.85 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  47.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  47.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  48.98 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  26.67 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  38.1 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  47.06 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  35.48 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  43.14 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  33.33 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  35.29 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  33.33 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  33.33 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  45.1 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  37.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  37.1 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  28.87 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  32.71 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  32.43 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  31.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  32.14 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  32.99 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  36 
 
 		 287 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  43.14 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  38.71 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  34.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  39.22 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  38.71 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  38.71 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  38.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  29.89 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  33.33 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  33.87 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  31.25 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  33.7 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  32.79 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  32.61 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.03 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  28.28 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  28.07 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  27.62 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  41.18 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.94 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  35.71 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  31.52 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32.22 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  35.48 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  34.18 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  39.29 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  31.52 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  38.98 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32.22 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  33.7 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  38.18 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.17 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  32.18 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  38.71 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  33.87 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  30.1 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  40.32 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>