114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0033 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  85.25 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  81.6 
 
 		 125 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  78.69 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  78.69 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  78.69 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  78.99 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  78.99 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  78.99 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  77.05 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  76.47 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  75.63 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  51.59 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  51.94 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  51.82 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  50.44 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  56.63 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  48.51 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  53.33 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  53.41 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  45.26 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  49.44 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  48.39 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  45.26 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  46.43 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  49.4 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  42.39 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  26.44 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  35.29 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  28 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  25.88 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  30 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  27.71 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  25 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  30.3 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.43 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  28.75 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  26.61 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  32 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  26.51 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  26.51 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  34.57 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  28.74 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  30.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  30.67 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  30 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  31.43 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  25.25 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  27 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  29.58 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  31.43 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  30.12 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  31.43 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.94 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  26.09 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  23.53 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  30 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  31.37 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  24.69 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  34.78 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  31.37 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  28.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  35.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  28.26 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  30.43 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  26.15 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  20.79 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  30.77 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  30.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  30.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  30.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  26.92 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  32.2 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  24.05 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  34.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  25.81 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  22.11 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  22.73 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  25.88 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  30.99 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  41.38 
 
 		 100 aa  42  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  30.77 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  31.37 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  31.37 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  20 
 
 		 120 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  27.18 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  29.41 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  29.69 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>