108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2659 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  53.45 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  48.33 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  56.25 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  53.57 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  57.83 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  53.01 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  54.22 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  50.56 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  54.22 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  54.22 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  50.56 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  49.44 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  48.86 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  51.22 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  47.19 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  42.52 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  47.19 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  47.73 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  42.48 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  52.56 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  51.11 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  52.56 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  48.91 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  41.18 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  48.75 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  29.85 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  32.04 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  29.49 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  29.49 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  32 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  35.09 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  32.04 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  32.18 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  34.85 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  32.18 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  32.18 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  31.17 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30.77 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  32.47 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  26.88 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  31.17 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  31.58 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  27.96 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  29.79 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  26.67 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  31.17 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  27.27 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  34.67 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.16 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.58 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.32 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.32 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  27.66 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  31.31 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.17 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  31.17 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  31.58 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  31.58 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  41.18 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  30.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.42 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  31.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  28.38 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  27.59 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  31.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  24.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  29.41 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  28.85 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  37.5 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  29.49 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  31.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  29.31 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  29.31 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  31.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  31.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  29.31 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  31.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  31.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>