137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3386 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  61.47 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  60.83 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  59.5 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  50.38 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  55.06 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  55 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  52.94 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  56.63 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  51.4 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  53.01 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  50.57 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  53.66 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  51.72 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  52.44 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  51.72 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  51.72 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  52.44 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  51.72 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  56.32 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  53.76 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  54.88 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  53.66 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  53.76 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  52.13 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  48.81 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  51.22 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  50.59 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  44.44 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  34.88 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  35 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  34.65 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  48 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  31.43 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  42.25 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  33.96 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  34.48 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  32.26 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  34.48 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  41.07 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  38.46 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  39.68 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  31.65 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  38.46 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  38.46 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  32.76 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  38.18 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  42 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  38.46 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  38.96 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  41.07 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  30.12 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  30.77 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  40 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  33.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  29.49 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  34.09 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  30.65 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  34.18 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  38.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  28.57 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  38.03 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  41.18 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  35.09 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  32.56 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  39.22 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  34.55 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  25.61 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  32.81 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  33.93 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  30.12 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  33.75 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  29.91 
 
 		 555 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  33.9 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  34.69 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  37.25 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  38.33 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  29.49 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  34.55 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  38.18 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  29.49 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  29.49 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  31.75 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  39.62 
 
 		 105 aa  44.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  32.26 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  34.62 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  30.77 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>