121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2564 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  95.35 
 
 		 129 aa  230  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  63.64 
 
 		 134 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  58.12 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  53.08 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  60.71 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  56.73 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  56.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  49.53 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  46.85 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  48.39 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  47.78 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  51.22 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  47.78 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  51.22 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  51.22 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  46.79 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  46.08 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  50 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  46.74 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  46.07 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  46.34 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  47.56 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  30.67 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  30.67 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  30.67 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  30.67 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  29.33 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  26.21 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  28.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  29.33 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  30.67 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  30.67 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  30.67 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  30.3 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  30.3 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  30.3 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  27.54 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  31.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  26.8 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  32.91 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  26.8 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  37.25 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  36.54 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  30.43 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  36 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  27.45 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  33.85 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  28.43 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  26.32 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  36.11 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  28.26 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  23.53 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  27.59 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  30 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  26.21 
 
 		 555 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  32 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  23.75 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  23.75 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  32.26 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  26.32 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  33.7 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  32.31 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  29.58 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  26.39 
 
 		 124 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.03 
 
 		 129 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  32.5 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  25.77 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  30.26 
 
 		 113 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  27.27 
 
 		 139 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  30.36 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  31.88 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  31.88 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  31.88 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>