44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0118 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  61.45 
 
 
135 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  55.21 
 
 
126 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  52.88 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  51.4 
 
 
134 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  53.33 
 
 
125 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  52.88 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  50.54 
 
 
130 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  51.92 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  50.96 
 
 
126 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  50.96 
 
 
126 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  49.07 
 
 
126 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  57.89 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  53.12 
 
 
126 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  53.12 
 
 
126 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  55.45 
 
 
134 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  53.12 
 
 
126 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  51.58 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  56.18 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  44.04 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  47.96 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  50 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  42.52 
 
 
130 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  46.43 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  46.43 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  41.07 
 
 
127 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  50.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  38.71 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  32.97 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  31.17 
 
 
137 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  32.1 
 
 
125 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  23.73 
 
 
133 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  27.94 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  23.29 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.33 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  36.23 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  36.07 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>