139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3359 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  92 
 
 		 126 aa  234  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  79.84 
 
 		 129 aa  206  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  55.28 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  54.47 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  54.47 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  54.47 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  54.47 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  54.47 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  56.2 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  53.66 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  52.5 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  52.5 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  46.09 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  55.32 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  55.21 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  46.46 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  53.76 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  52.56 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  50.6 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  51.85 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  48.15 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  46.79 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  48.19 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  36.36 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28.26 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  32.98 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  34.94 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  27.17 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  29.66 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  36.36 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  36.36 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  26.14 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.25 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  28.26 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  22.73 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  36.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  25 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  35.06 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  35.06 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  25.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  32.89 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  22.83 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  29.25 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  24.42 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  29.87 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  27.06 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  28.87 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  27.38 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  25.62 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  24.04 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  22.78 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  32.53 
 
 		 117 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  27 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  35.21 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  29.87 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  30.23 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  26.21 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  26.21 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  32.56 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  27.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  30.67 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  30.34 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  29.58 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  31.08 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  26.21 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  29.35 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  26.76 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  30.95 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  33.8 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.22 
 
 		 406 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  33.9 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.86 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  27.96 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  29.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  32.31 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  25.77 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  33.85 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  30.56 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  28.95 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  21.79 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  30.26 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  27.96 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  27.96 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  32.43 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  26.58 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  30.26 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>