40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3568 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  70.54 
 
 		 134 aa  201  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  55.05 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  55.05 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  55.05 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  56.25 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  56.25 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  56.25 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  50.44 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  48.84 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  55.1 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  53.68 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  46.09 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  52.04 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  53.76 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  46.09 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  54.74 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  55.95 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  52.27 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  50.96 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  44.79 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  46.34 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  50.59 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  47.56 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  48.75 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  48.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  40.43 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  47.56 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  38.46 
 
 		 123 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  32.81 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  33.33 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>