95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2987 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  61.47 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  57.98 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  58.12 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  51.49 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  50.93 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  48.33 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  55.32 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  54.17 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  54.26 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  51.81 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  47.83 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  49.45 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  49.45 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  47.83 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  49.45 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  48.51 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  51.65 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  48.35 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  50.55 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  51.65 
 
 		 123 aa  100  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  48.81 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  44.04 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  44.79 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  42.35 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  41.07 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  29.03 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  33.8 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  27.93 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  27.93 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  27.36 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  33.82 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  29.87 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  31.03 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  35.09 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  30.77 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.21 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  35.14 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  30.95 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  35.29 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.58 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  23.71 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  23.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  24.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  34.18 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  33.87 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  34.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  28.21 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  29.27 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  32.81 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  35.48 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  33.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.53 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  34.38 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  31.25 
 
 		 145 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  34.12 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  35.48 
 
 		 203 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  36.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.09 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  32.91 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  30 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  33.87 
 
 		 140 aa  40.8  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  36.84 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  27.27 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  31 
 
 		 555 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  31.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  27.38 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  24.29 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  31.75 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  24 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  22.34 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  30.53 
 
 		 242 aa  40  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  26.85 
 
 		 131 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30 
 
 		 88 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  29.82 
 
 		 140 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>