More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88514 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  100 
 
 		 555 aa  1135    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  38.98 
 
 		 513 aa  336  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  34.5 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  24.27 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  29.67 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 570 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  37.4 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  32.21 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  26.86 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  33.09 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  33.59 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  30.95 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  34.65 
 
 		 106 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  35.87 
 
 		 93 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  29.71 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  22.02 
 
 		 731 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  27.72 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  25.13 
 
 		 272 aa  67  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  35 
 
 		 140 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  34.94 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  35.71 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  34.26 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  32.53 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  36.14 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  34.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.05 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  33.33 
 
 		 125 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  24.6 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  34.52 
 
 		 122 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  35 
 
 		 145 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  27.96 
 
 		 106 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  33.73 
 
 		 146 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  30.17 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  30.59 
 
 		 131 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  34.52 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  29.47 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  32.05 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  30.12 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  30.12 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  31.73 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  32.14 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  33.33 
 
 		 104 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  34.52 
 
 		 139 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26259  predicted protein  35.82 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.734547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  32.14 
 
 		 123 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  32.38 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  34.88 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  40 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  33.77 
 
 		 104 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  33.75 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43223  predicted protein  33.33 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  28.97 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.71 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  30.1 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  32.47 
 
 		 153 aa  57  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  38.61 
 
 		 98 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  34.83 
 
 		 145 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  30.12 
 
 		 121 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  31.33 
 
 		 145 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  38.71 
 
 		 109 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  34.52 
 
 		 122 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  30.95 
 
 		 122 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  33.72 
 
 		 110 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  36.59 
 
 		 185 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  30.1 
 
 		 140 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  31 
 
 		 145 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  34.62 
 
 		 123 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  31.4 
 
 		 142 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  28.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  32.97 
 
 		 107 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  27.74 
 
 		 257 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  33.73 
 
 		 147 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  36.99 
 
 		 110 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  38.36 
 
 		 109 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  33.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  29.76 
 
 		 120 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  33.91 
 
 		 108 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  32.5 
 
 		 104 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  33.33 
 
 		 145 aa  54.7  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  35.09 
 
 		 110 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  32.56 
 
 		 105 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  32.5 
 
 		 126 aa  54.7  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  25.23 
 
 		 144 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>