More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02410 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1005    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  44.69 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  34.5 
 
 		 555 aa  280  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  27.46 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  44.88 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  35.14 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  43.64 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  42.99 
 
 		 220 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  45.45 
 
 		 93 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  35.34 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  24.89 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  34.62 
 
 		 106 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  37.07 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  37.96 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  47.62 
 
 		 81 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  41.51 
 
 		 146 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  41.51 
 
 		 146 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  42.45 
 
 		 125 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.74 
 
 		 146 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  38.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  44.44 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  37.14 
 
 		 145 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  41.98 
 
 		 145 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  36 
 
 		 106 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.17 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  31.25 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  45.45 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  34.55 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  41.57 
 
 		 110 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  39.53 
 
 		 144 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  35.92 
 
 		 145 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  41.98 
 
 		 139 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  38.37 
 
 		 144 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  39.24 
 
 		 127 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  34.91 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  43.04 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  40 
 
 		 105 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  38.75 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  35.19 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  38.75 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.3 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.63 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  41.46 
 
 		 146 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  37.93 
 
 		 147 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  30.91 
 
 		 144 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.3 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  24.81 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  33.02 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  33.02 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  38.75 
 
 		 122 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  35.16 
 
 		 139 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  40.45 
 
 		 109 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  36.05 
 
 		 107 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  42.31 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  30.7 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  41.46 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  33.72 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  38.82 
 
 		 105 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  32.08 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  30.56 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  38.75 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  31.78 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  36.19 
 
 		 123 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  44.05 
 
 		 104 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  41.03 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.9 
 
 		 290 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  35.96 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  34.07 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  36.19 
 
 		 123 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  38.1 
 
 		 125 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  30.56 
 
 		 145 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  28.03 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  36.36 
 
 		 140 aa  67  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.02 
 
 		 110 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  38.89 
 
 		 142 aa  67  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  36.36 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  34.91 
 
 		 145 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  42.2 
 
 		 104 aa  67  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  40.51 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  42.2 
 
 		 104 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  38.64 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  32.56 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  32.56 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.64 
 
 		 108 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  33.03 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  28.03 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  32.56 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  38.27 
 
 		 123 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  42.2 
 
 		 104 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  35.56 
 
 		 141 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  32.56 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>