281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05350 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  100 
 
 
388 aa  800    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  30.77 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  43.64 
 
 
492 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  37.4 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  29.48 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  41.58 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  32.21 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  39.81 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  38.04 
 
 
570 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  35.29 
 
 
106 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  33.33 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  38.53 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  40.96 
 
 
81 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  40.62 
 
 
184 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  34.65 
 
 
220 aa  59.7  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  33.03 
 
 
731 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  34.52 
 
 
93 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  28 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43224  predicted protein  36.92 
 
 
835 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  30.56 
 
 
467 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  21.37 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  33.67 
 
 
280 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26259  predicted protein  36.84 
 
 
524 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.734547  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  30.91 
 
 
145 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  33.01 
 
 
108 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43223  predicted protein  31.65 
 
 
595 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  33.7 
 
 
145 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  33.7 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  31.25 
 
 
246 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  30.16 
 
 
289 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  33.65 
 
 
105 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  30.16 
 
 
289 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  27.97 
 
 
145 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  31.11 
 
 
110 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  31.53 
 
 
144 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  31.13 
 
 
513 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  33.33 
 
 
140 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  30.97 
 
 
109 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  32.26 
 
 
145 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  33.73 
 
 
146 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  26.72 
 
 
534 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  38.46 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  29.27 
 
 
146 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.44 
 
 
109 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  32.04 
 
 
111 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  31.07 
 
 
107 aa  49.7  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  29.55 
 
 
133 aa  49.7  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  32 
 
 
125 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  32.05 
 
 
137 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  26.67 
 
 
135 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  29.87 
 
 
123 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.63 
 
 
107 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  27.08 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  34.07 
 
 
140 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  24.55 
 
 
140 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  29.51 
 
 
119 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  36.84 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  31.87 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  31.87 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  25.44 
 
 
139 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.41 
 
 
146 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  32.56 
 
 
149 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  30.11 
 
 
107 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  31.87 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  31.87 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  26.83 
 
 
141 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  32.18 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  33.33 
 
 
113 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  38.46 
 
 
110 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  33.01 
 
 
140 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  30.09 
 
 
107 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  36.23 
 
 
117 aa  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  31.18 
 
 
146 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  31.03 
 
 
145 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30.56 
 
 
117 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.19 
 
 
108 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  31.87 
 
 
140 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  31.65 
 
 
138 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  31.18 
 
 
146 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34.25 
 
 
107 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  31.25 
 
 
146 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  36.67 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  31.07 
 
 
109 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  31.07 
 
 
109 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  29 
 
 
119 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  31.07 
 
 
109 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>