More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50192 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  100 
 
 
357 aa  731    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  32.5 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  31.56 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  26.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  37.04 
 
 
555 aa  76.3  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  36.54 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  24.19 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  33.33 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  28.1 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.33 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  38.1 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  34.26 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.74 
 
 
108 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  39.08 
 
 
113 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  38.1 
 
 
106 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  31.13 
 
 
108 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  34.29 
 
 
107 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  34.83 
 
 
107 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.02 
 
 
108 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  36.47 
 
 
109 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 
287 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  41.98 
 
 
109 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.37 
 
 
110 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  32.08 
 
 
108 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  37.21 
 
 
125 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34.52 
 
 
108 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  32.94 
 
 
107 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  32.69 
 
 
110 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  39.29 
 
 
107 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  37.04 
 
 
111 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  39.51 
 
 
106 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  40 
 
 
104 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  36.25 
 
 
113 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  40 
 
 
106 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  39.02 
 
 
108 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  39.02 
 
 
108 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  29.52 
 
 
731 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  39.8 
 
 
570 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  38.75 
 
 
107 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  38.75 
 
 
107 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  38.78 
 
 
98 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  35.23 
 
 
109 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.37 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.18 
 
 
109 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  34.29 
 
 
108 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  35.44 
 
 
107 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  35 
 
 
146 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  28.85 
 
 
133 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  34.48 
 
 
110 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  36.36 
 
 
106 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  31.78 
 
 
107 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  36.59 
 
 
108 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.5 
 
 
109 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  35.71 
 
 
107 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  35.96 
 
 
112 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  33.75 
 
 
146 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.41 
 
 
109 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.67 
 
 
108 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  34.09 
 
 
108 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  30.48 
 
 
108 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  33.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.02 
 
 
109 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  33.71 
 
 
107 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.05 
 
 
290 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.05 
 
 
290 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  34.09 
 
 
110 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  31.13 
 
 
112 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.05 
 
 
290 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  29.52 
 
 
119 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  31.46 
 
 
124 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  34.18 
 
 
108 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  29.91 
 
 
109 aa  59.7  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  32.56 
 
 
108 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  38.27 
 
 
109 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  59.7  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  27.88 
 
 
110 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.93 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  26.92 
 
 
110 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  30.11 
 
 
109 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.93 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  33.75 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  26.92 
 
 
110 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  31.07 
 
 
106 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>