More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32213 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  100 
 
 		 310 aa  637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  40.98 
 
 		 455 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  30.27 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  29.48 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  32.65 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  28.97 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  30.58 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 		 492 aa  68.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  29.27 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  30.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  26.92 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  28.1 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  26.03 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  30.53 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.62 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.68 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  31.48 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  34.44 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  28.72 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  26.28 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  32.26 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  27.03 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  31.52 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10584  predicted protein  35.71 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000798013  normal  0.0528572 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  28.03 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  29.35 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.22 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  31.76 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.12 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  27.78 
 
 		 110 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  32.56 
 
 		 109 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  44.26 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  29.07 
 
 		 110 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  31.82 
 
 		 107 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  33.73 
 
 		 106 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  35.29 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  29.55 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  31.33 
 
 		 104 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  28.28 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  29.27 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  29.27 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  29.21 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  34.09 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  34.04 
 
 		 133 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.52 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.68 
 
 		 148 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  27.47 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  25.25 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  32.18 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.47 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  27.27 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  27.27 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  29.9 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  32.26 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  29.35 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  32.93 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  31.78 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  28.09 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.85 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  29.67 
 
 		 108 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  29.17 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  31.82 
 
 		 124 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  29.41 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  32.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  26.96 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  31.52 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  27.78 
 
 		 106 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  26.35 
 
 		 145 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  28.09 
 
 		 110 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  31.71 
 
 		 111 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  29.35 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  31.4 
 
 		 108 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  29.67 
 
 		 113 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  28.09 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  32.95 
 
 		 113 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  30.12 
 
 		 125 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.17 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.12 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  33.73 
 
 		 120 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  32.58 
 
 		 109 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  28.41 
 
 		 123 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  31.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>