More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01370 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1182    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  25 
 
 		 731 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  29.47 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  27.69 
 
 		 411 aa  88.2  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  35.05 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  26.07 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  38.3 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  43.18 
 
 		 108 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  34.12 
 
 		 93 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  43.37 
 
 		 105 aa  77.4  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  43.02 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  39.58 
 
 		 106 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  37.63 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  39 
 
 		 112 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.98 
 
 		 110 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  26.24 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  40.91 
 
 		 108 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  38.64 
 
 		 107 aa  73.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  39.77 
 
 		 109 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  37.36 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.78 
 
 		 109 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  31.37 
 
 		 513 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  40.91 
 
 		 110 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  37 
 
 		 108 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  40.91 
 
 		 110 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  38.38 
 
 		 111 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  41.27 
 
 		 184 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  38.1 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  38.04 
 
 		 388 aa  72  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  39.77 
 
 		 108 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  37.78 
 
 		 106 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  37.37 
 
 		 109 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67636  predicted protein  22.41 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.969008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  37.21 
 
 		 107 aa  71.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.67 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.93 
 
 		 105 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  39.13 
 
 		 110 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.43 
 
 		 108 aa  71.2  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  39.77 
 
 		 109 aa  70.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  35.35 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  36 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  35.35 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  35.96 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.04 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  37.37 
 
 		 109 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  38.71 
 
 		 106 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  36.36 
 
 		 108 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  37 
 
 		 108 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  40 
 
 		 123 aa  70.1  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  41.33 
 
 		 109 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  37.37 
 
 		 109 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  29.63 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.36 
 
 		 287 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.48 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  34.78 
 
 		 105 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  37.21 
 
 		 107 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  29.63 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  35.35 
 
 		 109 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  38.64 
 
 		 116 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  26.29 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  38.64 
 
 		 110 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.94 
 
 		 105 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.82 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  39.51 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  38.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.44 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  35.63 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>