More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2808 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  100 
 
 
272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  38.53 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  44.72 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  34.65 
 
 
455 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  37.96 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  41.18 
 
 
106 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  36.52 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  38.53 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  48.78 
 
 
110 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  42.05 
 
 
110 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  26 
 
 
555 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  36.73 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  38.1 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  30.53 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  35.65 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.68 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  28.57 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  39.53 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10584  predicted protein  39.51 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000798013  normal  0.0528572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  41.46 
 
 
109 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  41.77 
 
 
109 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  49.12 
 
 
93 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  41.46 
 
 
107 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  42.5 
 
 
108 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  35.79 
 
 
105 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  41.77 
 
 
104 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  40.51 
 
 
108 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  37.93 
 
 
108 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  42.31 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  42.31 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  39.02 
 
 
107 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  39.02 
 
 
107 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  29.2 
 
 
467 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  31.78 
 
 
108 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.08 
 
 
148 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  41.03 
 
 
113 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  38.82 
 
 
136 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  39.02 
 
 
107 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  41.33 
 
 
109 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 
570 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  36.71 
 
 
108 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  32.41 
 
 
107 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  37.35 
 
 
102 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  34.18 
 
 
108 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  34.18 
 
 
108 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  34.18 
 
 
108 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  45.21 
 
 
107 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  34.48 
 
 
108 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  39.08 
 
 
107 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  37.18 
 
 
105 aa  58.9  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  33.64 
 
 
443 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  35.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  37.8 
 
 
107 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  38.32 
 
 
108 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  34.02 
 
 
106 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  39.24 
 
 
107 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  32.91 
 
 
108 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  33.64 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  39.74 
 
 
107 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  37.97 
 
 
108 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  32.08 
 
 
107 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  39.24 
 
 
107 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  44.87 
 
 
116 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  39.47 
 
 
106 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  34.02 
 
 
119 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  36.47 
 
 
107 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  38.96 
 
 
106 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  35.44 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  39.73 
 
 
159 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  35 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  37.18 
 
 
147 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.59 
 
 
107 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  37.5 
 
 
112 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  32.71 
 
 
106 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.04 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  38.78 
 
 
120 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  35.44 
 
 
108 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  38.75 
 
 
108 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  40.24 
 
 
123 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  35.05 
 
 
106 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  39.24 
 
 
125 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.59 
 
 
107 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>