116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_87395 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  100 
 
 
534 aa  1113    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  25.94 
 
 
467 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  25.28 
 
 
513 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  25.38 
 
 
520 aa  127  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  26.92 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  25.32 
 
 
513 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  28.24 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67636  predicted protein  33.33 
 
 
769 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.969008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  34.21 
 
 
139 aa  57  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  32.89 
 
 
139 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  28.8 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  34.25 
 
 
193 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  32.89 
 
 
139 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  33.33 
 
 
93 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  29.73 
 
 
106 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  26.95 
 
 
220 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  28.23 
 
 
411 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  26.72 
 
 
388 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  28.45 
 
 
368 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  31.58 
 
 
145 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  29.41 
 
 
731 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  26.96 
 
 
130 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  25.2 
 
 
555 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  33.77 
 
 
145 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  33.77 
 
 
145 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  29.29 
 
 
500 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  29.47 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  32.18 
 
 
150 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  27.63 
 
 
139 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.58 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.58 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  27.63 
 
 
139 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  31.51 
 
 
81 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  32.53 
 
 
122 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  32.22 
 
 
150 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  32.95 
 
 
123 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  32.95 
 
 
123 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  29.67 
 
 
145 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  26.02 
 
 
125 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  31.03 
 
 
140 aa  47  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.16 
 
 
131 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  32.22 
 
 
150 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  34.48 
 
 
123 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  28.95 
 
 
144 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  28.77 
 
 
126 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  25 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  29.73 
 
 
162 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  24.76 
 
 
120 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  36.49 
 
 
144 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  26.47 
 
 
144 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  34.62 
 
 
105 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  26.47 
 
 
144 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  32.22 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  25.51 
 
 
246 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  31.08 
 
 
141 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  25.2 
 
 
125 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  30.85 
 
 
159 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  38.64 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  27.37 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  25 
 
 
120 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  25.81 
 
 
223 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  34.07 
 
 
105 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.96 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  35.14 
 
 
144 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  31.46 
 
 
124 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  32.43 
 
 
149 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  26.21 
 
 
154 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  28.24 
 
 
443 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10584  predicted protein  34.62 
 
 
81 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000798013  normal  0.0528572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  28.09 
 
 
149 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.88 
 
 
281 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  29.11 
 
 
289 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  34.62 
 
 
123 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  30.77 
 
 
104 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46359  predicted protein  30.12 
 
 
357 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  35.14 
 
 
144 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  28.95 
 
 
154 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  25 
 
 
407 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  29.82 
 
 
112 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  27.59 
 
 
107 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  28 
 
 
184 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.09 
 
 
110 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  29.11 
 
 
289 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>