14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85013 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  100 
 
 
407 aa  845    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  36.36 
 
 
437 aa  289  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  33.9 
 
 
422 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  30.27 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  25.3 
 
 
404 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  27.38 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  24.52 
 
 
500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  20.95 
 
 
431 aa  92.8  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07679  COPII-coated vesicle protein (Erv41), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01530)  23.31 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  21.16 
 
 
467 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53869  predicted protein  29.17 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157249  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  22.89 
 
 
520 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  24.26 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  25 
 
 
534 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>