15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01500 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  100 
 
 
422 aa  883    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  40.18 
 
 
437 aa  324  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  33.9 
 
 
407 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  29.61 
 
 
379 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  29.81 
 
 
404 aa  192  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  27.84 
 
 
500 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  28.71 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  25.35 
 
 
431 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  24.37 
 
 
310 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07679  COPII-coated vesicle protein (Erv41), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01530)  22.83 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  24.31 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  26.87 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  23.53 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53869  predicted protein  24.08 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157249  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50271  predicted protein  24.36 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>