14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53869 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53869  predicted protein  100 
 
 
352 aa  721    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157249  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  36.49 
 
 
431 aa  216  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07679  COPII-coated vesicle protein (Erv41), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01530)  34.26 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  35.78 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  22.74 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  30.22 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  29.7 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  23.4 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  24.07 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  24.42 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  29.19 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  23.68 
 
 
467 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50271  predicted protein  21.81 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  23.3 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>