15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9509 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  100 
 
 
404 aa  845    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  29.81 
 
 
422 aa  192  8e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  30.42 
 
 
379 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  26.84 
 
 
437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  25.3 
 
 
407 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  25.73 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  25.06 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  23.36 
 
 
431 aa  89.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4637  predicted protein  28.12 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53869  predicted protein  29.69 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.157249  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  23.12 
 
 
520 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  23.61 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50271  predicted protein  25.87 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07679  COPII-coated vesicle protein (Erv41), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01530)  20.99 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  23.66 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>