More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11781 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  100 
 
 
106 aa  221  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  36 
 
 
492 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  30.84 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  31.68 
 
 
513 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  31.96 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.18 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_7719  predicted protein  32.91 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0652282  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  29 
 
 
731 aa  62  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  34.57 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36.84 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  28.4 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  27.96 
 
 
555 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  36.84 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  34.62 
 
 
411 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  34.18 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.71 
 
 
238 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  32.93 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  30.86 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  30.86 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  35.05 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  34.15 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  36.08 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  35.79 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  34.15 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  34.15 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  35.96 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  31.71 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  36.36 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  29.81 
 
 
357 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  31.65 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  30.49 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  28.4 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  35.8 
 
 
150 aa  57  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  31.65 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  31.96 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  35.79 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.16 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  35.79 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  32.18 
 
 
310 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
570 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  35.92 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  35.35 
 
 
259 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  35.05 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  30 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  32.67 
 
 
223 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  36 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  35.8 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  33.33 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  29.13 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  27 
 
 
287 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  33.68 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  27.72 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  26.21 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  31 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  32.91 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  35.44 
 
 
259 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  36.84 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.5 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  35.06 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  30.49 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  32 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  31.71 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  25.96 
 
 
287 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  30 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  31.71 
 
 
301 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.17 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  33.01 
 
 
108 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.71 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  30.38 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
148 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  30.38 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  40.98 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  39.34 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  33.67 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  40 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  30.38 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  27.45 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  27.1 
 
 
455 aa  53.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  37 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  32.94 
 
 
257 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  31 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>