121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3682 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  92 
 
 		 126 aa  234  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  81.4 
 
 		 129 aa  207  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  58.68 
 
 		 123 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  56.1 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  58.68 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  54.33 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  54.17 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  51.59 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  54.17 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  46.09 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  54.26 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  46.46 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  56.18 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  48.39 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  53.76 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  53.01 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  52.56 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  50.62 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  46.91 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  46.74 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  46.74 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  32.29 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  35.71 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  31.91 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  35.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  35.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  32.29 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  26.97 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  33.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  23.4 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  26.09 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  35.06 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  29.82 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30.59 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  24.73 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  25 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  28.95 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  28.32 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  33.77 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  23.96 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  23.91 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.25 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  28.4 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  22.92 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  33.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  31.08 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  27.62 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  22.78 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  26.32 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  25.64 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  28.21 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  35.59 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  27.54 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  27.38 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  22.73 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  27.85 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  31.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  32.89 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  31.82 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  31.71 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.59 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.59 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  29.07 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  28.57 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  27.27 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  26.92 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  29.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  25 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  31.25 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  34.29 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  21.79 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  32.63 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  27.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  27.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  35.09 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  25.93 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  30.3 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  33.87 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  29.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  27 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  25 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  27.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.49 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  30.12 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  30.49 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  27.5 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>