More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2669 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  43.27 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  46.6 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  44.23 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  40.38 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  37.86 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  36.54 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  37.38 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  33.71 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  38.14 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  32.26 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  28.04 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  36.73 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  34.65 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  32.41 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  31.68 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.96 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  36.89 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.58 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  36.17 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.29 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.29 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.29 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  31.73 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  35.85 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  36.08 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  33.67 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  31.96 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  28.7 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.96 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.68 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  30.77 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  31.68 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  30.56 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  32.32 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  30.48 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  34.31 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.59 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  30.56 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.05 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  30.19 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  32.32 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  31.37 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  28.71 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  35.48 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.67 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  33.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  31.68 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  32.35 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  30.3 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  31.87 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  28.57 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  37.65 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  29.25 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  31.37 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  31.37 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  31.37 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  31.37 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  26.26 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  35.42 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>