More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0241 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  72.38 
 
 		 108 aa  163  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  70.48 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  66.67 
 
 		 109 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  63.81 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  54.81 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  44.19 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  34.34 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  35.29 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.67 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  34.31 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  31.68 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  31.68 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  32.29 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.68 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  30.84 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.79 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  27.08 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  32.61 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  31.58 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  36.45 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  34.94 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.04 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  31.58 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  27.88 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  30.93 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.59 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  32.67 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  32.35 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  28.85 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  26.92 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  29.29 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  28.57 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  31.68 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.67 
 
 		 259 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  30.21 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  31.37 
 
 		 238 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  27.66 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  27.18 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  28.12 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  30.61 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30.95 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  29.59 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  30.3 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  29.17 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.04 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.43 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  31.68 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  31.87 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  30.48 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  33.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30 
 
 		 406 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.97 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  31 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  28.12 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  27.88 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  28.12 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  27.08 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  25.74 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  26.47 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.24 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  28.42 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  32.93 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  29.29 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  26.47 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  28.12 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.77 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  28.87 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  27.08 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  30.39 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  28.87 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  26.04 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  29.55 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  26.47 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  27.84 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>