More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4889 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  63.81 
 
 		 107 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  63.21 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  61.68 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  63.21 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  48.15 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  43.02 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.81 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  31.18 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  34.94 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  27.88 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  33 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  23.58 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  28.97 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  28.97 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  27.96 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  27.45 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  28.04 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  30 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  34.52 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  29.89 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  26.04 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  24.51 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  26.47 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  31.87 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  22 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  24.51 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  26.04 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  23 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  29.41 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.18 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  34.07 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  28.28 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  22 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  27.27 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  27.45 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  29.41 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  29.25 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  24.51 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  24.49 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  23 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  22 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  23 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  23.76 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  25.53 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  23.66 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  28.3 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  27.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  23.66 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  23.66 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  27.36 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  25.81 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  23.66 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  28.42 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  23.66 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  22.55 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  24.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  25.74 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0629  hypothetical protein  23.81 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  27.47 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  25.24 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  28.05 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  29.7 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  26.26 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  22.55 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  24.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  29.63 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  23.6 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  21.88 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  22.55 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  21.88 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  26.88 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  24.53 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  29.03 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  24.75 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  27.84 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  27 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  25.53 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  25 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  26.37 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  25 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  23.3 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  26.26 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>