More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0117 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 105 aa  213  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  61.9 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  44.76 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  54.88 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  47.67 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  48.42 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  49.45 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  46.07 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2776  Thioredoxin domain protein  44.12 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.33686e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  43.18 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  49.47 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  51.22 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  48.35 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.14 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  44.32 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.32 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.18 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25210  thioredoxin domain-containing protein  41.84 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000120815  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.32 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.32 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  43.68 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  41.86 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  85.9  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.86 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  40.91 
 
 		 223 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  49.37 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  43.18 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  40.78 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  42.7 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  48.1 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  45.12 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  48.1 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0744  thioredoxin  39.05 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0188431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  44.94 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  39.22 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40.45 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  43.02 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  40.78 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  41.86 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  39.77 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  41.86 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  41.05 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  42.22 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.7 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  44.32 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  43.3 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  44.58 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  45.78 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  43.18 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  45.78 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  43.27 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  50 
 
 		 370 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.86 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  46.84 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  41.33 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  39.22 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  40.7 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  39.77 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  43.18 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  39.53 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  39.05 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  35.92 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  36.27 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  39.53 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  33.71 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  39.53 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  42.05 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  39.02 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  41.86 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  42.05 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  41.46 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  42.68 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  37.08 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  37.76 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  41.46 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  45.12 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  42.35 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  42.05 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  37.08 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  38.64 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>