More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2776 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2776  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
105 aa  216  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.33686e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25210  thioredoxin domain-containing protein  50.5 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000120815  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0744  thioredoxin  47.52 
 
 
105 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0188431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  42.57 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  44.12 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  40.95 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  37.65 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  38.24 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  31.96 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  39.24 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.37 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  33.02 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  38.82 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  33.02 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.03 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  33.02 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  35.48 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  32.71 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.02 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  37.8 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.59 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  36.36 
 
 
238 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  33.02 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  38.1 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  31.43 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  36.56 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  32.95 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  37.35 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  34.52 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  40 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  34.31 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.76 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.8 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  32.5 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  36.25 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  31.19 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  31.11 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  28.43 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  33.65 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  34.31 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34.31 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  30.43 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  32.04 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  34.41 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  30.1 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  35.05 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  34.41 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  35.9 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  33.98 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  35.9 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  35.29 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  32.58 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30.68 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  32.22 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  30.28 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  30.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  32.94 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  36.25 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  39.24 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  32.91 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  32.67 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.12 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  36.36 
 
 
289 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  35.9 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  35.44 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  37.04 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  32.91 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  31.13 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  36.36 
 
 
289 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  37.35 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  34.15 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  34.52 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  30.93 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  31.58 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  32.91 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.39 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  30.77 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  30.77 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  30 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  34.62 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  31.13 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  34.62 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  32.58 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>