More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0744 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0744  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  222  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0188431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25210  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000120815  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  47.62 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2776  Thioredoxin domain protein  47.52 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.33686e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  43.81 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  39.05 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  39.08 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  44.94 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  37.25 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  41.77 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  39.33 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  36.19 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  36.19 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  34.44 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.09 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  34.48 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  35.64 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.96 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  35.23 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  32.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  39.33 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  35.29 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  35.64 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  33.66 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  40.45 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  34.29 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  36.19 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  34.31 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.71 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  37.08 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  35.37 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  38.37 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  35.37 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  34.44 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  38.1 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  35.37 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  38.37 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.69 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  34.83 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.58 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.15 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  34.65 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.78 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  32.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  33.66 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  36.36 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  38.2 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.83 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  30.48 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  32.58 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  38.2 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  36.05 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  32.38 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  35.23 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  38.2 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.71 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  33.71 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  32.67 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  32.38 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  32.95 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  37.08 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  31.11 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  33.72 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  31.11 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>