More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0626 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  64.81 
 
 		 108 aa  153  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  66.67 
 
 		 107 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  66.67 
 
 		 107 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  61.68 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  39.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  34.02 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  31.37 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  32.63 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.38 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  32.63 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  30.93 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.63 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  32.65 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  32.98 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  30.77 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  32.99 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.9 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  31.96 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  31.96 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  33.71 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  31.18 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36.25 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  29 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  30 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.45 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  27.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  27.84 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  32.22 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  29.9 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  29.36 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.87 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  32.35 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.87 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  30.21 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  33.72 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  26.8 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  34.02 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  33.7 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.97 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  32.18 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.94 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  29.59 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  34.94 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  27.84 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  28.89 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  30.34 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  34.15 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  32.22 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  36.96 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  29.03 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  30.34 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  32.26 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  29.35 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  30.34 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  29 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  26.85 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  29.03 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>