More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0859 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 107 aa  216  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  70.48 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  66.98 
 
 		 108 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  66.67 
 
 		 109 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  63.21 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  54.72 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  45.35 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  29.25 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29.59 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.39 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  34.31 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.39 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  27.45 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  27.55 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  27.55 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.55 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.47 
 
 		 110 aa  66.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  32.99 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  27.55 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  26.92 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  26.53 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  26.53 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  30.3 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  30.61 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  28.57 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  27.37 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  30.48 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  30.11 
 
 		 259 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  27.72 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  27.72 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  28.16 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  26.37 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  25.47 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  29.21 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  26.37 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  30.93 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  30.39 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  30.93 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  25.26 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  27.27 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  25.71 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  27.62 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  29.63 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.69 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  27.84 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  27.84 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.12 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  30.84 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.58 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.12 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  29.9 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.71 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  26.17 
 
 		 293 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  26.37 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  27.84 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  34.15 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  27.66 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  26.73 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  25.51 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  29.29 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  26.8 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  26.8 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  32.94 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  26.8 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  32.94 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  26.8 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  25.23 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  29.29 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  25.27 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  26.32 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  26.47 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  25.77 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  28.71 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  32.94 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.94 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  26.26 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  24.75 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>